Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Kdm6bQ5NCY0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Kdm6bQ5NCY0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Kdm6bQ5NCY0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Kdm6bQ5NCY0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Kdm6bQ5NCY0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Kdm6bQ5NCY0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Kdm6bQ5NCY0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Kdm6bQ5NCY0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Kdm6bQ5NCY0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Kdm6bQ5NCY0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Kdm6bQ5NCY0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Kdm6bQ5NCY0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Kdm6bQ5NCY0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Kdm6bQ5NCY0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Kdm6bQ5NCY0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Kdm6bQ5NCY0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Kdm6bQ5NCY0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Kdm6bQ5NCY0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Kdm6bQ5NCY0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Kdm6bQ5NCY0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Kdm6bQ5NCY0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Kdm6bQ5NCY0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Kdm6bQ5NCY0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Kdm6bQ5NCY0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Kdm6bQ5NCY0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Kdm6bQ5NCY0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Kdm6bQ5NCY0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Kdm6bQ5NCY0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Kdm6bQ5NCY0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Kdm6bQ5NCY0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Kdm6bQ5NCY0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Kdm6bQ5NCY0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Kdm6bQ5NCY0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Kdm6bQ5NCY0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Kdm6bQ5NCY0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Kdm6bQ5NCY0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Kdm6bQ5NCY0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Kdm6bQ5NCY0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Kdm6bQ5NCY0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Kdm6bQ5NCY0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Kdm6bQ5NCY0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Kdm6bQ5NCY0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Kdm6bQ5NCY0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Kdm6bQ5NCY0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Kdm6bQ5NCY0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Kdm6bQ5NCY0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Kdm6bQ5NCY0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Kdm6bQ5NCY0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Kdm6bQ5NCY0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Kdm6bQ5NCY0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Kdm6bQ5NCY0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Kdm6bQ5NCY0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Kdm6bQ5NCY0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Kdm6bQ5NCY0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Kdm6bQ5NCY0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Kdm6bQ5NCY0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
Kdm6bQ5NCY0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Kdm6bQ5NCY0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Kdm6bQ5NCY0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Kdm6bQ5NCY0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Kdm6bQ5NCY0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Kdm6bQ5NCY0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Kdm6bQ5NCY0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Kdm6bQ5NCY0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Kdm6bQ5NCY0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Kdm6bQ5NCY0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Kdm6bQ5NCY0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Kdm6bQ5NCY0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Kdm6bQ5NCY0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Kdm6bQ5NCY0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Kdm6bQ5NCY0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Kdm6bQ5NCY0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Kdm6bQ5NCY0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Kdm6bQ5NCY0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Kdm6bQ5NCY0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Kdm6bQ5NCY0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Kdm6bQ5NCY0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Kdm6bQ5NCY0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Kdm6bQ5NCY0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Kdm6bQ5NCY0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Kdm6bQ5NCY0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Kdm6bQ5NCY0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Kdm6bQ5NCY0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Kdm6bQ5NCY0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Kdm6bQ5NCY0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Kdm6bQ5NCY0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.45■■■■□ 3.26
Kdm6bQ5NCY0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Kdm6bQ5NCY0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Kdm6bQ5NCY0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm6bQ5NCY0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm6bQ5NCY0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm6bQ5NCY0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Kdm6bQ5NCY0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Kdm6bQ5NCY0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Kdm6bQ5NCY0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Kdm6bQ5NCY0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Kdm6bQ5NCY0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Kdm6bQ5NCY0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm6bQ5NCY0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms