Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC57

Fam183b, Protein FAM183B, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam183bQ5NC57 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam183bQ5NC57 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam183bQ5NC57 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam183bQ5NC57 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam183bQ5NC57 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam183bQ5NC57 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam183bQ5NC57 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam183bQ5NC57 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam183bQ5NC57 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam183bQ5NC57 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam183bQ5NC57 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam183bQ5NC57 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam183bQ5NC57 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam183bQ5NC57 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam183bQ5NC57 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam183bQ5NC57 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam183bQ5NC57 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam183bQ5NC57 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam183bQ5NC57 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam183bQ5NC57 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam183bQ5NC57 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam183bQ5NC57 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam183bQ5NC57 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam183bQ5NC57 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam183bQ5NC57 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam183bQ5NC57 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam183bQ5NC57 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam183bQ5NC57 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam183bQ5NC57 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Fam183bQ5NC57 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam183bQ5NC57 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam183bQ5NC57 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam183bQ5NC57 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam183bQ5NC57 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Fam183bQ5NC57 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam183bQ5NC57 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam183bQ5NC57 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fam183bQ5NC57 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam183bQ5NC57 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam183bQ5NC57 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam183bQ5NC57 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fam183bQ5NC57 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam183bQ5NC57 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam183bQ5NC57 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam183bQ5NC57 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam183bQ5NC57 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam183bQ5NC57 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam183bQ5NC57 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam183bQ5NC57 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam183bQ5NC57 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fam183bQ5NC57 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam183bQ5NC57 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam183bQ5NC57 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam183bQ5NC57 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam183bQ5NC57 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam183bQ5NC57 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam183bQ5NC57 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam183bQ5NC57 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam183bQ5NC57 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam183bQ5NC57 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam183bQ5NC57 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam183bQ5NC57 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam183bQ5NC57 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam183bQ5NC57 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam183bQ5NC57 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam183bQ5NC57 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam183bQ5NC57 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam183bQ5NC57 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam183bQ5NC57 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam183bQ5NC57 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam183bQ5NC57 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam183bQ5NC57 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam183bQ5NC57 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam183bQ5NC57 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam183bQ5NC57 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam183bQ5NC57 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms