Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Ecm2Q5FW85 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ecm2Q5FW85 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Ecm2Q5FW85 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ecm2Q5FW85 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ecm2Q5FW85 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Ecm2Q5FW85 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ecm2Q5FW85 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ecm2Q5FW85 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ecm2Q5FW85 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ecm2Q5FW85 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ecm2Q5FW85 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ecm2Q5FW85 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ecm2Q5FW85 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ecm2Q5FW85 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ecm2Q5FW85 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ecm2Q5FW85 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ecm2Q5FW85 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ecm2Q5FW85 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ecm2Q5FW85 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ecm2Q5FW85 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ecm2Q5FW85 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ecm2Q5FW85 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Ecm2Q5FW85 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ecm2Q5FW85 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ecm2Q5FW85 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ecm2Q5FW85 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ecm2Q5FW85 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ecm2Q5FW85 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ecm2Q5FW85 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ecm2Q5FW85 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ecm2Q5FW85 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ecm2Q5FW85 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ecm2Q5FW85 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ecm2Q5FW85 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ecm2Q5FW85 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ecm2Q5FW85 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ecm2Q5FW85 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Ecm2Q5FW85 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ecm2Q5FW85 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ecm2Q5FW85 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ecm2Q5FW85 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ecm2Q5FW85 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ecm2Q5FW85 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ecm2Q5FW85 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ecm2Q5FW85 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ecm2Q5FW85 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ecm2Q5FW85 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Ecm2Q5FW85 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ecm2Q5FW85 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ecm2Q5FW85 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ecm2Q5FW85 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ecm2Q5FW85 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ecm2Q5FW85 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ecm2Q5FW85 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ecm2Q5FW85 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Ecm2Q5FW85 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ecm2Q5FW85 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ecm2Q5FW85 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Ecm2Q5FW85 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ecm2Q5FW85 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ecm2Q5FW85 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ecm2Q5FW85 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ecm2Q5FW85 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ecm2Q5FW85 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ecm2Q5FW85 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ecm2Q5FW85 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ecm2Q5FW85 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ecm2Q5FW85 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ecm2Q5FW85 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ecm2Q5FW85 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ecm2Q5FW85 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
Ecm2Q5FW85 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ecm2Q5FW85 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ecm2Q5FW85 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ecm2Q5FW85 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ecm2Q5FW85 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ecm2Q5FW85 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ecm2Q5FW85 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ecm2Q5FW85 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ecm2Q5FW85 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ecm2Q5FW85 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ecm2Q5FW85 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ecm2Q5FW85 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Ecm2Q5FW85 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Ecm2Q5FW85 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ecm2Q5FW85 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ecm2Q5FW85 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ecm2Q5FW85 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ecm2Q5FW85 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ecm2Q5FW85 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ecm2Q5FW85 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ecm2Q5FW85 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ecm2Q5FW85 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ecm2Q5FW85 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ecm2Q5FW85 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ecm2Q5FW85 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ecm2Q5FW85 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ecm2Q5FW85 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ecm2Q5FW85 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 299 ms