Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chsy3Q5DTK1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chsy3Q5DTK1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chsy3Q5DTK1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chsy3Q5DTK1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chsy3Q5DTK1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chsy3Q5DTK1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chsy3Q5DTK1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chsy3Q5DTK1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chsy3Q5DTK1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chsy3Q5DTK1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chsy3Q5DTK1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chsy3Q5DTK1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chsy3Q5DTK1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chsy3Q5DTK1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chsy3Q5DTK1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chsy3Q5DTK1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chsy3Q5DTK1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chsy3Q5DTK1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chsy3Q5DTK1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chsy3Q5DTK1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chsy3Q5DTK1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chsy3Q5DTK1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chsy3Q5DTK1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chsy3Q5DTK1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chsy3Q5DTK1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chsy3Q5DTK1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chsy3Q5DTK1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chsy3Q5DTK1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chsy3Q5DTK1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chsy3Q5DTK1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chsy3Q5DTK1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chsy3Q5DTK1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chsy3Q5DTK1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chsy3Q5DTK1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chsy3Q5DTK1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chsy3Q5DTK1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.5 ms