Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDF6

Cfhr2, Complement factor H-related 2, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfhr2Q4LDF6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfhr2Q4LDF6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfhr2Q4LDF6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cfhr2Q4LDF6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfhr2Q4LDF6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfhr2Q4LDF6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cfhr2Q4LDF6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfhr2Q4LDF6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cfhr2Q4LDF6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfhr2Q4LDF6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfhr2Q4LDF6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfhr2Q4LDF6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cfhr2Q4LDF6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfhr2Q4LDF6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cfhr2Q4LDF6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfhr2Q4LDF6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfhr2Q4LDF6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfhr2Q4LDF6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfhr2Q4LDF6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfhr2Q4LDF6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cfhr2Q4LDF6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfhr2Q4LDF6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfhr2Q4LDF6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfhr2Q4LDF6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cfhr2Q4LDF6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfhr2Q4LDF6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfhr2Q4LDF6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfhr2Q4LDF6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cfhr2Q4LDF6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cfhr2Q4LDF6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cfhr2Q4LDF6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfhr2Q4LDF6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfhr2Q4LDF6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cfhr2Q4LDF6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfhr2Q4LDF6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfhr2Q4LDF6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cfhr2Q4LDF6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfhr2Q4LDF6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfhr2Q4LDF6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cfhr2Q4LDF6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfhr2Q4LDF6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfhr2Q4LDF6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfhr2Q4LDF6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfhr2Q4LDF6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cfhr2Q4LDF6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cfhr2Q4LDF6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cfhr2Q4LDF6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cfhr2Q4LDF6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cfhr2Q4LDF6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cfhr2Q4LDF6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cfhr2Q4LDF6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cfhr2Q4LDF6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfhr2Q4LDF6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cfhr2Q4LDF6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfhr2Q4LDF6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfhr2Q4LDF6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfhr2Q4LDF6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cfhr2Q4LDF6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfhr2Q4LDF6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfhr2Q4LDF6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cfhr2Q4LDF6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cfhr2Q4LDF6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfhr2Q4LDF6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfhr2Q4LDF6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfhr2Q4LDF6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfhr2Q4LDF6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cfhr2Q4LDF6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfhr2Q4LDF6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfhr2Q4LDF6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfhr2Q4LDF6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cfhr2Q4LDF6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cfhr2Q4LDF6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cfhr2Q4LDF6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cfhr2Q4LDF6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cfhr2Q4LDF6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cfhr2Q4LDF6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cfhr2Q4LDF6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cfhr2Q4LDF6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms