Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc110Q3V125 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc110Q3V125 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc110Q3V125 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc110Q3V125 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc110Q3V125 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc110Q3V125 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc110Q3V125 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc110Q3V125 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc110Q3V125 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc110Q3V125 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc110Q3V125 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc110Q3V125 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc110Q3V125 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc110Q3V125 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc110Q3V125 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc110Q3V125 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc110Q3V125 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc110Q3V125 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc110Q3V125 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc110Q3V125 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc110Q3V125 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc110Q3V125 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc110Q3V125 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc110Q3V125 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc110Q3V125 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc110Q3V125 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc110Q3V125 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc110Q3V125 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc110Q3V125 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc110Q3V125 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc110Q3V125 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc110Q3V125 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc110Q3V125 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc110Q3V125 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc110Q3V125 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc110Q3V125 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc110Q3V125 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc110Q3V125 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc110Q3V125 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc110Q3V125 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc110Q3V125 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc110Q3V125 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc110Q3V125 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc110Q3V125 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc110Q3V125 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc110Q3V125 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc110Q3V125 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc110Q3V125 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc110Q3V125 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc110Q3V125 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc110Q3V125 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc110Q3V125 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc110Q3V125 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc110Q3V125 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc110Q3V125 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms