Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Garnl3Q3V0G7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Garnl3Q3V0G7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Garnl3Q3V0G7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Garnl3Q3V0G7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Garnl3Q3V0G7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Garnl3Q3V0G7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Garnl3Q3V0G7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Garnl3Q3V0G7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Garnl3Q3V0G7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Garnl3Q3V0G7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Garnl3Q3V0G7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Garnl3Q3V0G7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Garnl3Q3V0G7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Garnl3Q3V0G7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Garnl3Q3V0G7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Garnl3Q3V0G7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Garnl3Q3V0G7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Garnl3Q3V0G7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Garnl3Q3V0G7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Garnl3Q3V0G7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Garnl3Q3V0G7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Garnl3Q3V0G7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Garnl3Q3V0G7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Garnl3Q3V0G7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Garnl3Q3V0G7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Garnl3Q3V0G7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Garnl3Q3V0G7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Garnl3Q3V0G7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Garnl3Q3V0G7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Garnl3Q3V0G7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Garnl3Q3V0G7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Garnl3Q3V0G7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Garnl3Q3V0G7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Garnl3Q3V0G7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Garnl3Q3V0G7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Garnl3Q3V0G7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Garnl3Q3V0G7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Garnl3Q3V0G7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Garnl3Q3V0G7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Garnl3Q3V0G7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Garnl3Q3V0G7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Garnl3Q3V0G7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms