Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UZV7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UZV7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3UZV7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3UZV7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3UZV7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q3UZV7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3UZV7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3UZV7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3UZV7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3UZV7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3UZV7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q3UZV7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q3UZV7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3UZV7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q3UZV7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3UZV7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3UZV7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q3UZV7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3UZV7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3UZV7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3UZV7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3UZV7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3UZV7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q3UZV7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UZV7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UZV7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UZV7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UZV7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UZV7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UZV7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q3UZV7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3UZV7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3UZV7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3UZV7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3UZV7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UZV7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UZV7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UZV7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UZV7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UZV7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UZV7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3UZV7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UZV7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UZV7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UZV7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3UZV7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3UZV7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3UZV7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3UZV7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3UZV7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3UZV7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UZV7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UZV7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UZV7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UZV7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3UZV7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Q3UZV7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3UZV7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3UZV7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3UZV7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3UZV7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3UZV7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3UZV7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3UZV7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3UZV7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3UZV7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3UZV7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3UZV7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3UZV7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3UZV7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3UZV7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3UZV7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3UZV7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3UZV7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3UZV7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3UZV7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3UZV7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3UZV7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3UZV7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q3UZV7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q3UZV7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UZV7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UZV7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UZV7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3UZV7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UZV7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UZV7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UZV7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3UZV7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Q3UZV7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UZV7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UZV7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3UZV7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3UZV7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UZV7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q3UZV7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UZV7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3UZV7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3UZV7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms