Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaaf3Q3UYV8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaaf3Q3UYV8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaaf3Q3UYV8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaaf3Q3UYV8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaaf3Q3UYV8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaaf3Q3UYV8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf3Q3UYV8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaaf3Q3UYV8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnaaf3Q3UYV8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnaaf3Q3UYV8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf3Q3UYV8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaaf3Q3UYV8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnaaf3Q3UYV8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnaaf3Q3UYV8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnaaf3Q3UYV8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnaaf3Q3UYV8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Dnaaf3Q3UYV8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dnaaf3Q3UYV8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dnaaf3Q3UYV8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms