Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C87499Q3UX49 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C87499Q3UX49 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
C87499Q3UX49 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C87499Q3UX49 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C87499Q3UX49 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C87499Q3UX49 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C87499Q3UX49 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C87499Q3UX49 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C87499Q3UX49 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C87499Q3UX49 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C87499Q3UX49 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C87499Q3UX49 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C87499Q3UX49 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C87499Q3UX49 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C87499Q3UX49 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C87499Q3UX49 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C87499Q3UX49 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C87499Q3UX49 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
C87499Q3UX49 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C87499Q3UX49 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
C87499Q3UX49 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C87499Q3UX49 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
C87499Q3UX49 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C87499Q3UX49 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C87499Q3UX49 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C87499Q3UX49 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C87499Q3UX49 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C87499Q3UX49 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C87499Q3UX49 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C87499Q3UX49 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C87499Q3UX49 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C87499Q3UX49 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C87499Q3UX49 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C87499Q3UX49 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C87499Q3UX49 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C87499Q3UX49 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C87499Q3UX49 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C87499Q3UX49 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C87499Q3UX49 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C87499Q3UX49 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C87499Q3UX49 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C87499Q3UX49 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C87499Q3UX49 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C87499Q3UX49 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C87499Q3UX49 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C87499Q3UX49 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C87499Q3UX49 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
C87499Q3UX49 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C87499Q3UX49 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C87499Q3UX49 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C87499Q3UX49 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C87499Q3UX49 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C87499Q3UX49 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C87499Q3UX49 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C87499Q3UX49 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C87499Q3UX49 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C87499Q3UX49 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C87499Q3UX49 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C87499Q3UX49 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C87499Q3UX49 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C87499Q3UX49 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C87499Q3UX49 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C87499Q3UX49 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C87499Q3UX49 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C87499Q3UX49 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
C87499Q3UX49 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C87499Q3UX49 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C87499Q3UX49 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C87499Q3UX49 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C87499Q3UX49 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C87499Q3UX49 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C87499Q3UX49 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C87499Q3UX49 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C87499Q3UX49 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C87499Q3UX49 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C87499Q3UX49 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C87499Q3UX49 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C87499Q3UX49 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms