Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTB2

A630001G21Rik, RIKEN cDNA A630001G21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A630001G21RikQ3UTB2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A630001G21RikQ3UTB2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A630001G21RikQ3UTB2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A630001G21RikQ3UTB2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A630001G21RikQ3UTB2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A630001G21RikQ3UTB2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A630001G21RikQ3UTB2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A630001G21RikQ3UTB2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A630001G21RikQ3UTB2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A630001G21RikQ3UTB2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A630001G21RikQ3UTB2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A630001G21RikQ3UTB2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A630001G21RikQ3UTB2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A630001G21RikQ3UTB2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A630001G21RikQ3UTB2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A630001G21RikQ3UTB2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A630001G21RikQ3UTB2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A630001G21RikQ3UTB2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A630001G21RikQ3UTB2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A630001G21RikQ3UTB2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A630001G21RikQ3UTB2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A630001G21RikQ3UTB2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A630001G21RikQ3UTB2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A630001G21RikQ3UTB2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A630001G21RikQ3UTB2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A630001G21RikQ3UTB2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A630001G21RikQ3UTB2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A630001G21RikQ3UTB2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A630001G21RikQ3UTB2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A630001G21RikQ3UTB2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A630001G21RikQ3UTB2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A630001G21RikQ3UTB2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A630001G21RikQ3UTB2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A630001G21RikQ3UTB2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A630001G21RikQ3UTB2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A630001G21RikQ3UTB2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A630001G21RikQ3UTB2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A630001G21RikQ3UTB2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A630001G21RikQ3UTB2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A630001G21RikQ3UTB2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A630001G21RikQ3UTB2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A630001G21RikQ3UTB2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A630001G21RikQ3UTB2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A630001G21RikQ3UTB2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A630001G21RikQ3UTB2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A630001G21RikQ3UTB2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A630001G21RikQ3UTB2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A630001G21RikQ3UTB2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A630001G21RikQ3UTB2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A630001G21RikQ3UTB2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A630001G21RikQ3UTB2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A630001G21RikQ3UTB2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A630001G21RikQ3UTB2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A630001G21RikQ3UTB2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A630001G21RikQ3UTB2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A630001G21RikQ3UTB2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A630001G21RikQ3UTB2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A630001G21RikQ3UTB2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A630001G21RikQ3UTB2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A630001G21RikQ3UTB2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A630001G21RikQ3UTB2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A630001G21RikQ3UTB2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A630001G21RikQ3UTB2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A630001G21RikQ3UTB2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A630001G21RikQ3UTB2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A630001G21RikQ3UTB2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A630001G21RikQ3UTB2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A630001G21RikQ3UTB2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A630001G21RikQ3UTB2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A630001G21RikQ3UTB2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A630001G21RikQ3UTB2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A630001G21RikQ3UTB2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A630001G21RikQ3UTB2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A630001G21RikQ3UTB2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A630001G21RikQ3UTB2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A630001G21RikQ3UTB2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A630001G21RikQ3UTB2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A630001G21RikQ3UTB2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A630001G21RikQ3UTB2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms