Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cracr2aQ3UP38 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cracr2aQ3UP38 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cracr2aQ3UP38 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cracr2aQ3UP38 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cracr2aQ3UP38 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cracr2aQ3UP38 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cracr2aQ3UP38 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cracr2aQ3UP38 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cracr2aQ3UP38 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cracr2aQ3UP38 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cracr2aQ3UP38 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cracr2aQ3UP38 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cracr2aQ3UP38 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cracr2aQ3UP38 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cracr2aQ3UP38 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cracr2aQ3UP38 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cracr2aQ3UP38 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cracr2aQ3UP38 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cracr2aQ3UP38 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cracr2aQ3UP38 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cracr2aQ3UP38 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cracr2aQ3UP38 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cracr2aQ3UP38 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cracr2aQ3UP38 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cracr2aQ3UP38 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cracr2aQ3UP38 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cracr2aQ3UP38 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cracr2aQ3UP38 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cracr2aQ3UP38 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cracr2aQ3UP38 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cracr2aQ3UP38 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cracr2aQ3UP38 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cracr2aQ3UP38 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cracr2aQ3UP38 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cracr2aQ3UP38 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cracr2aQ3UP38 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cracr2aQ3UP38 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cracr2aQ3UP38 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cracr2aQ3UP38 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cracr2aQ3UP38 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cracr2aQ3UP38 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cracr2aQ3UP38 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cracr2aQ3UP38 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cracr2aQ3UP38 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cracr2aQ3UP38 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cracr2aQ3UP38 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cracr2aQ3UP38 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cracr2aQ3UP38 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cracr2aQ3UP38 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cracr2aQ3UP38 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cracr2aQ3UP38 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cracr2aQ3UP38 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cracr2aQ3UP38 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cracr2aQ3UP38 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cracr2aQ3UP38 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cracr2aQ3UP38 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms