Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cln5Q3UMW8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cln5Q3UMW8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cln5Q3UMW8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cln5Q3UMW8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cln5Q3UMW8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cln5Q3UMW8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cln5Q3UMW8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cln5Q3UMW8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cln5Q3UMW8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cln5Q3UMW8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cln5Q3UMW8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cln5Q3UMW8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cln5Q3UMW8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cln5Q3UMW8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cln5Q3UMW8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cln5Q3UMW8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cln5Q3UMW8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cln5Q3UMW8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cln5Q3UMW8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cln5Q3UMW8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cln5Q3UMW8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cln5Q3UMW8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cln5Q3UMW8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cln5Q3UMW8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cln5Q3UMW8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cln5Q3UMW8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cln5Q3UMW8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms