Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMT1

Ppp1r12c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r12cQ3UMT1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r12cQ3UMT1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r12cQ3UMT1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r12cQ3UMT1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r12cQ3UMT1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r12cQ3UMT1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp1r12cQ3UMT1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp1r12cQ3UMT1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp1r12cQ3UMT1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp1r12cQ3UMT1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ppp1r12cQ3UMT1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r12cQ3UMT1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp1r12cQ3UMT1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp1r12cQ3UMT1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp1r12cQ3UMT1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp1r12cQ3UMT1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp1r12cQ3UMT1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp1r12cQ3UMT1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp1r12cQ3UMT1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppp1r12cQ3UMT1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppp1r12cQ3UMT1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppp1r12cQ3UMT1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppp1r12cQ3UMT1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppp1r12cQ3UMT1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp1r12cQ3UMT1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp1r12cQ3UMT1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp1r12cQ3UMT1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp1r12cQ3UMT1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppp1r12cQ3UMT1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppp1r12cQ3UMT1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ppp1r12cQ3UMT1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppp1r12cQ3UMT1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppp1r12cQ3UMT1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppp1r12cQ3UMT1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppp1r12cQ3UMT1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppp1r12cQ3UMT1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppp1r12cQ3UMT1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ppp1r12cQ3UMT1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ppp1r12cQ3UMT1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppp1r12cQ3UMT1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppp1r12cQ3UMT1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp1r12cQ3UMT1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp1r12cQ3UMT1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp1r12cQ3UMT1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp1r12cQ3UMT1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp1r12cQ3UMT1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp1r12cQ3UMT1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp1r12cQ3UMT1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp1r12cQ3UMT1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp1r12cQ3UMT1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp1r12cQ3UMT1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp1r12cQ3UMT1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ppp1r12cQ3UMT1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ppp1r12cQ3UMT1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp1r12cQ3UMT1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp1r12cQ3UMT1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp1r12cQ3UMT1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp1r12cQ3UMT1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp1r12cQ3UMT1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp1r12cQ3UMT1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp1r12cQ3UMT1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp1r12cQ3UMT1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp1r12cQ3UMT1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp1r12cQ3UMT1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp1r12cQ3UMT1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r12cQ3UMT1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp1r12cQ3UMT1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp1r12cQ3UMT1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms