Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM45

Ppp1r7, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r7Q3UM45 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r7Q3UM45 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppp1r7Q3UM45 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp1r7Q3UM45 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppp1r7Q3UM45 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppp1r7Q3UM45 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp1r7Q3UM45 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp1r7Q3UM45 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp1r7Q3UM45 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp1r7Q3UM45 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp1r7Q3UM45 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp1r7Q3UM45 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp1r7Q3UM45 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp1r7Q3UM45 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp1r7Q3UM45 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp1r7Q3UM45 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp1r7Q3UM45 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp1r7Q3UM45 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp1r7Q3UM45 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp1r7Q3UM45 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms