Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrxosQ3UL53 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrxosQ3UL53 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CrxosQ3UL53 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CrxosQ3UL53 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrxosQ3UL53 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrxosQ3UL53 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrxosQ3UL53 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrxosQ3UL53 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrxosQ3UL53 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrxosQ3UL53 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrxosQ3UL53 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrxosQ3UL53 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrxosQ3UL53 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrxosQ3UL53 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrxosQ3UL53 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrxosQ3UL53 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrxosQ3UL53 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrxosQ3UL53 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrxosQ3UL53 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrxosQ3UL53 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrxosQ3UL53 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrxosQ3UL53 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CrxosQ3UL53 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CrxosQ3UL53 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrxosQ3UL53 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrxosQ3UL53 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrxosQ3UL53 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrxosQ3UL53 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrxosQ3UL53 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrxosQ3UL53 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrxosQ3UL53 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrxosQ3UL53 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrxosQ3UL53 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrxosQ3UL53 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CrxosQ3UL53 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CrxosQ3UL53 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CrxosQ3UL53 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CrxosQ3UL53 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CrxosQ3UL53 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CrxosQ3UL53 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CrxosQ3UL53 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CrxosQ3UL53 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CrxosQ3UL53 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CrxosQ3UL53 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CrxosQ3UL53 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CrxosQ3UL53 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CrxosQ3UL53 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CrxosQ3UL53 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms