Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Usp19Q3UJD6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Usp19Q3UJD6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Usp19Q3UJD6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Usp19Q3UJD6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Usp19Q3UJD6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Usp19Q3UJD6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Usp19Q3UJD6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Usp19Q3UJD6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Usp19Q3UJD6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Usp19Q3UJD6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Usp19Q3UJD6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Usp19Q3UJD6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Usp19Q3UJD6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Usp19Q3UJD6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Usp19Q3UJD6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Usp19Q3UJD6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Usp19Q3UJD6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Usp19Q3UJD6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Usp19Q3UJD6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Usp19Q3UJD6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Usp19Q3UJD6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Usp19Q3UJD6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Usp19Q3UJD6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Usp19Q3UJD6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Usp19Q3UJD6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Usp19Q3UJD6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Usp19Q3UJD6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Usp19Q3UJD6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Usp19Q3UJD6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Usp19Q3UJD6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Usp19Q3UJD6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Usp19Q3UJD6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Usp19Q3UJD6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Usp19Q3UJD6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Usp19Q3UJD6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Usp19Q3UJD6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Usp19Q3UJD6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Usp19Q3UJD6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Usp19Q3UJD6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Usp19Q3UJD6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Usp19Q3UJD6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Usp19Q3UJD6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Usp19Q3UJD6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Usp19Q3UJD6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Usp19Q3UJD6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Usp19Q3UJD6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Usp19Q3UJD6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Usp19Q3UJD6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Usp19Q3UJD6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Usp19Q3UJD6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Usp19Q3UJD6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Usp19Q3UJD6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Usp19Q3UJD6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Usp19Q3UJD6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Usp19Q3UJD6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Usp19Q3UJD6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Usp19Q3UJD6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Usp19Q3UJD6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Usp19Q3UJD6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Usp19Q3UJD6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Usp19Q3UJD6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Usp19Q3UJD6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Usp19Q3UJD6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Usp19Q3UJD6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Usp19Q3UJD6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Usp19Q3UJD6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Usp19Q3UJD6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Usp19Q3UJD6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Usp19Q3UJD6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Usp19Q3UJD6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Usp19Q3UJD6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Usp19Q3UJD6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Usp19Q3UJD6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Usp19Q3UJD6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Usp19Q3UJD6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Usp19Q3UJD6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Usp19Q3UJD6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Usp19Q3UJD6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Usp19Q3UJD6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Usp19Q3UJD6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Usp19Q3UJD6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Usp19Q3UJD6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Usp19Q3UJD6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Usp19Q3UJD6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Usp19Q3UJD6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Usp19Q3UJD6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Usp19Q3UJD6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Usp19Q3UJD6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Usp19Q3UJD6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Usp19Q3UJD6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Usp19Q3UJD6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Usp19Q3UJD6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Usp19Q3UJD6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Usp19Q3UJD6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Usp19Q3UJD6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Usp19Q3UJD6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Usp19Q3UJD6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Usp19Q3UJD6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Usp19Q3UJD6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms