Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf44Q3UHJ8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf44Q3UHJ8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf44Q3UHJ8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf44Q3UHJ8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rnf44Q3UHJ8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf44Q3UHJ8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf44Q3UHJ8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf44Q3UHJ8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf44Q3UHJ8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf44Q3UHJ8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf44Q3UHJ8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf44Q3UHJ8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf44Q3UHJ8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf44Q3UHJ8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf44Q3UHJ8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf44Q3UHJ8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf44Q3UHJ8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf44Q3UHJ8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf44Q3UHJ8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf44Q3UHJ8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf44Q3UHJ8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf44Q3UHJ8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf44Q3UHJ8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf44Q3UHJ8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf44Q3UHJ8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf44Q3UHJ8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf44Q3UHJ8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf44Q3UHJ8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf44Q3UHJ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf44Q3UHJ8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf44Q3UHJ8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf44Q3UHJ8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf44Q3UHJ8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf44Q3UHJ8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf44Q3UHJ8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms