Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LchnQ3UHG7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LchnQ3UHG7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LchnQ3UHG7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LchnQ3UHG7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LchnQ3UHG7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LchnQ3UHG7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LchnQ3UHG7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LchnQ3UHG7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LchnQ3UHG7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LchnQ3UHG7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LchnQ3UHG7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LchnQ3UHG7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LchnQ3UHG7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LchnQ3UHG7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LchnQ3UHG7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LchnQ3UHG7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LchnQ3UHG7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LchnQ3UHG7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LchnQ3UHG7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LchnQ3UHG7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LchnQ3UHG7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LchnQ3UHG7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LchnQ3UHG7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LchnQ3UHG7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LchnQ3UHG7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LchnQ3UHG7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LchnQ3UHG7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LchnQ3UHG7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LchnQ3UHG7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LchnQ3UHG7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LchnQ3UHG7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LchnQ3UHG7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LchnQ3UHG7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LchnQ3UHG7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LchnQ3UHG7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LchnQ3UHG7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LchnQ3UHG7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LchnQ3UHG7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LchnQ3UHG7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LchnQ3UHG7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LchnQ3UHG7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LchnQ3UHG7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LchnQ3UHG7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LchnQ3UHG7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LchnQ3UHG7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LchnQ3UHG7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms