Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rnft2Q3UF64 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnft2Q3UF64 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnft2Q3UF64 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnft2Q3UF64 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms