Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf166Q3U9F6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf166Q3U9F6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf166Q3U9F6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf166Q3U9F6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf166Q3U9F6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf166Q3U9F6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf166Q3U9F6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf166Q3U9F6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf166Q3U9F6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf166Q3U9F6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf166Q3U9F6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf166Q3U9F6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf166Q3U9F6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf166Q3U9F6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf166Q3U9F6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf166Q3U9F6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf166Q3U9F6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf166Q3U9F6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf166Q3U9F6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf166Q3U9F6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf166Q3U9F6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf166Q3U9F6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf166Q3U9F6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf166Q3U9F6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf166Q3U9F6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf166Q3U9F6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf166Q3U9F6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf166Q3U9F6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnf166Q3U9F6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnf166Q3U9F6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf166Q3U9F6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf166Q3U9F6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf166Q3U9F6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf166Q3U9F6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf166Q3U9F6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf166Q3U9F6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf166Q3U9F6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf166Q3U9F6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf166Q3U9F6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf166Q3U9F6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf166Q3U9F6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf166Q3U9F6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf166Q3U9F6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf166Q3U9F6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf166Q3U9F6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf166Q3U9F6 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf166Q3U9F6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf166Q3U9F6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rnf166Q3U9F6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf166Q3U9F6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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