Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3U7U4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3U7U4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3U7U4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3U7U4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3U7U4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3U7U4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3U7U4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3U7U4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3U7U4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3U7U4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3U7U4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3U7U4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3U7U4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3U7U4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3U7U4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3U7U4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3U7U4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3U7U4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3U7U4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3U7U4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3U7U4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3U7U4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3U7U4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q3U7U4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3U7U4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3U7U4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3U7U4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3U7U4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q3U7U4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3U7U4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q3U7U4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3U7U4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3U7U4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3U7U4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q3U7U4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q3U7U4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3U7U4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q3U7U4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3U7U4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Q3U7U4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q3U7U4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3U7U4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3U7U4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3U7U4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3U7U4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3U7U4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3U7U4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3U7U4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3U7U4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3U7U4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3U7U4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3U7U4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3U7U4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3U7U4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3U7U4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3U7U4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3U7U4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3U7U4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3U7U4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3U7U4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3U7U4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3U7U4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3U7U4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3U7U4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3U7U4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3U7U4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3U7U4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3U7U4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3U7U4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3U7U4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3U7U4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3U7U4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3U7U4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3U7U4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3U7U4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3U7U4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3U7U4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms