Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3U595 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3U595 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3U595 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3U595 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3U595 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q3U595 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U595 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U595 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U595 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q3U595 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3U595 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3U595 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3U595 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q3U595 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q3U595 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q3U595 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3U595 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3U595 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q3U595 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U595 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U595 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U595 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U595 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U595 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U595 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U595 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Q3U595 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U595 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U595 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U595 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U595 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q3U595 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U595 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U595 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U595 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U595 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q3U595 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3U595 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3U595 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3U595 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q3U595 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3U595 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3U595 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3U595 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3U595 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3U595 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q3U595 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3U595 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3U595 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q3U595 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U595 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U595 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U595 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U595 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Q3U595 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U595 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U595 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U595 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U595 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3U595 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3U595 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3U595 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3U595 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U595 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U595 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3U595 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U595 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U595 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3U595 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3U595 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U595 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U595 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U595 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3U595 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U595 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U595 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U595 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3U595 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U595 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q3U595 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U595 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U595 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U595 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U595 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U595 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U595 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q3U595 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3U595 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q3U595 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q3U595 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3U595 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3U595 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q3U595 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3U595 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3U595 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3U595 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3U595 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3U595 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q3U595 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms