Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
VwceQ3U515 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
VwceQ3U515 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
VwceQ3U515 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22,34■■□□□ 1,17
VwceQ3U515 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22,32■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22,31■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22,31■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22,31■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22,29■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22,28■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22,28■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22,28■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,28■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
VwceQ3U515 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
VwceQ3U515 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,26■■□□□ 1,15
VwceQ3U515 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
VwceQ3U515 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
VwceQ3U515 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
VwceQ3U515 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22,25■■□□□ 1,15
VwceQ3U515 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
VwceQ3U515 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,24■■□□□ 1,15
VwceQ3U515 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
VwceQ3U515 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
VwceQ3U515 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,22■■□□□ 1,15
VwceQ3U515 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,22■■□□□ 1,15
VwceQ3U515 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
VwceQ3U515 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
VwceQ3U515 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22,22■■□□□ 1,15
VwceQ3U515 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22,22■■□□□ 1,15
VwceQ3U515 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22,21■■□□□ 1,15
VwceQ3U515 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
VwceQ3U515 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22,21■■□□□ 1,15
VwceQ3U515 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
VwceQ3U515 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22,21■■□□□ 1,15
VwceQ3U515 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
VwceQ3U515 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22,2■■□□□ 1,14
VwceQ3U515 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
VwceQ3U515 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22,19■■□□□ 1,14
VwceQ3U515 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,19■■□□□ 1,14
VwceQ3U515 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22,18■■□□□ 1,14
VwceQ3U515 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22,18■■□□□ 1,14
VwceQ3U515 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
VwceQ3U515 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22,17■■□□□ 1,14
VwceQ3U515 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
VwceQ3U515 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
VwceQ3U515 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
VwceQ3U515 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
VwceQ3U515 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
VwceQ3U515 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,15■■□□□ 1,14
VwceQ3U515 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,14
VwceQ3U515 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22,14■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,13■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22,13■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22,13■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22,13■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22,13■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,12■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22,12■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22,11■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22,11■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,1■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22,09■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22,09■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
VwceQ3U515 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22,08■■□□□ 1,12
VwceQ3U515 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
VwceQ3U515 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
VwceQ3U515 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
VwceQ3U515 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
VwceQ3U515 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
VwceQ3U515 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22,06■■□□□ 1,12
VwceQ3U515 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22,06■■□□□ 1,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52,4 ms