Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hectd3Q3U487 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hectd3Q3U487 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hectd3Q3U487 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hectd3Q3U487 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hectd3Q3U487 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hectd3Q3U487 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hectd3Q3U487 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hectd3Q3U487 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hectd3Q3U487 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hectd3Q3U487 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hectd3Q3U487 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hectd3Q3U487 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hectd3Q3U487 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hectd3Q3U487 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hectd3Q3U487 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hectd3Q3U487 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hectd3Q3U487 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hectd3Q3U487 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hectd3Q3U487 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms