Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pag1Q3U1F9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pag1Q3U1F9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pag1Q3U1F9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pag1Q3U1F9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pag1Q3U1F9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pag1Q3U1F9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pag1Q3U1F9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pag1Q3U1F9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pag1Q3U1F9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pag1Q3U1F9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pag1Q3U1F9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pag1Q3U1F9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pag1Q3U1F9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pag1Q3U1F9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pag1Q3U1F9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pag1Q3U1F9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pag1Q3U1F9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pag1Q3U1F9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pag1Q3U1F9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pag1Q3U1F9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pag1Q3U1F9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pag1Q3U1F9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pag1Q3U1F9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pag1Q3U1F9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pag1Q3U1F9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pag1Q3U1F9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pag1Q3U1F9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pag1Q3U1F9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pag1Q3U1F9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pag1Q3U1F9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pag1Q3U1F9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pag1Q3U1F9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pag1Q3U1F9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pag1Q3U1F9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pag1Q3U1F9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pag1Q3U1F9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pag1Q3U1F9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pag1Q3U1F9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pag1Q3U1F9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pag1Q3U1F9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pag1Q3U1F9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pag1Q3U1F9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pag1Q3U1F9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pag1Q3U1F9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pag1Q3U1F9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pag1Q3U1F9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pag1Q3U1F9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pag1Q3U1F9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pag1Q3U1F9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pag1Q3U1F9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pag1Q3U1F9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pag1Q3U1F9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pag1Q3U1F9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pag1Q3U1F9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pag1Q3U1F9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms