Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc174Q3U155 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc174Q3U155 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc174Q3U155 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc174Q3U155 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc174Q3U155 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc174Q3U155 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc174Q3U155 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc174Q3U155 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc174Q3U155 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ccdc174Q3U155 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc174Q3U155 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc174Q3U155 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc174Q3U155 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc174Q3U155 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc174Q3U155 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc174Q3U155 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc174Q3U155 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc174Q3U155 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc174Q3U155 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc174Q3U155 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc174Q3U155 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc174Q3U155 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc174Q3U155 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Ccdc174Q3U155 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc174Q3U155 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc174Q3U155 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc174Q3U155 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc174Q3U155 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc174Q3U155 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc174Q3U155 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc174Q3U155 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc174Q3U155 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc174Q3U155 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc174Q3U155 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc174Q3U155 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc174Q3U155 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc174Q3U155 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc174Q3U155 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc174Q3U155 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc174Q3U155 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc174Q3U155 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc174Q3U155 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc174Q3U155 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc174Q3U155 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc174Q3U155 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc174Q3U155 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc174Q3U155 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc174Q3U155 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc174Q3U155 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc174Q3U155 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc174Q3U155 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc174Q3U155 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc174Q3U155 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc174Q3U155 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc174Q3U155 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc174Q3U155 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc174Q3U155 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc174Q3U155 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc174Q3U155 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc174Q3U155 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc174Q3U155 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc174Q3U155 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms