Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Hace1Q3U0D9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Hace1Q3U0D9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hace1Q3U0D9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hace1Q3U0D9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hace1Q3U0D9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hace1Q3U0D9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hace1Q3U0D9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hace1Q3U0D9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hace1Q3U0D9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hace1Q3U0D9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Hace1Q3U0D9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hace1Q3U0D9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hace1Q3U0D9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hace1Q3U0D9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hace1Q3U0D9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hace1Q3U0D9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hace1Q3U0D9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hace1Q3U0D9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hace1Q3U0D9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hace1Q3U0D9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Hace1Q3U0D9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Hace1Q3U0D9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hace1Q3U0D9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Hace1Q3U0D9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hace1Q3U0D9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hace1Q3U0D9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hace1Q3U0D9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hace1Q3U0D9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hace1Q3U0D9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hace1Q3U0D9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hace1Q3U0D9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hace1Q3U0D9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hace1Q3U0D9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hace1Q3U0D9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hace1Q3U0D9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hace1Q3U0D9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hace1Q3U0D9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hace1Q3U0D9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hace1Q3U0D9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hace1Q3U0D9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hace1Q3U0D9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hace1Q3U0D9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hace1Q3U0D9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hace1Q3U0D9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hace1Q3U0D9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Hace1Q3U0D9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hace1Q3U0D9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hace1Q3U0D9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hace1Q3U0D9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hace1Q3U0D9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hace1Q3U0D9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hace1Q3U0D9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Hace1Q3U0D9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hace1Q3U0D9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hace1Q3U0D9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms