Protein–RNA interactions for Protein: Q3U095

Nxpe2, NXPE family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe2Q3U095 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe2Q3U095 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nxpe2Q3U095 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxpe2Q3U095 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxpe2Q3U095 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxpe2Q3U095 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxpe2Q3U095 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nxpe2Q3U095 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxpe2Q3U095 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nxpe2Q3U095 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxpe2Q3U095 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxpe2Q3U095 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxpe2Q3U095 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxpe2Q3U095 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxpe2Q3U095 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxpe2Q3U095 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxpe2Q3U095 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxpe2Q3U095 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxpe2Q3U095 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxpe2Q3U095 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nxpe2Q3U095 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nxpe2Q3U095 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nxpe2Q3U095 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nxpe2Q3U095 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nxpe2Q3U095 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxpe2Q3U095 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nxpe2Q3U095 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nxpe2Q3U095 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nxpe2Q3U095 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nxpe2Q3U095 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nxpe2Q3U095 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nxpe2Q3U095 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nxpe2Q3U095 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nxpe2Q3U095 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nxpe2Q3U095 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nxpe2Q3U095 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nxpe2Q3U095 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nxpe2Q3U095 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nxpe2Q3U095 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nxpe2Q3U095 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nxpe2Q3U095 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nxpe2Q3U095 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nxpe2Q3U095 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nxpe2Q3U095 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nxpe2Q3U095 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nxpe2Q3U095 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nxpe2Q3U095 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nxpe2Q3U095 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nxpe2Q3U095 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nxpe2Q3U095 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nxpe2Q3U095 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nxpe2Q3U095 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nxpe2Q3U095 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nxpe2Q3U095 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nxpe2Q3U095 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nxpe2Q3U095 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nxpe2Q3U095 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nxpe2Q3U095 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nxpe2Q3U095 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nxpe2Q3U095 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nxpe2Q3U095 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nxpe2Q3U095 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nxpe2Q3U095 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nxpe2Q3U095 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nxpe2Q3U095 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nxpe2Q3U095 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nxpe2Q3U095 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nxpe2Q3U095 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nxpe2Q3U095 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nxpe2Q3U095 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nxpe2Q3U095 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nxpe2Q3U095 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nxpe2Q3U095 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nxpe2Q3U095 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nxpe2Q3U095 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nxpe2Q3U095 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nxpe2Q3U095 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms