Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkl4Q3TZA2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkl4Q3TZA2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkl4Q3TZA2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkl4Q3TZA2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkl4Q3TZA2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkl4Q3TZA2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdkl4Q3TZA2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdkl4Q3TZA2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdkl4Q3TZA2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkl4Q3TZA2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkl4Q3TZA2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkl4Q3TZA2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdkl4Q3TZA2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdkl4Q3TZA2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdkl4Q3TZA2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdkl4Q3TZA2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdkl4Q3TZA2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdkl4Q3TZA2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdkl4Q3TZA2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdkl4Q3TZA2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdkl4Q3TZA2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdkl4Q3TZA2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdkl4Q3TZA2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdkl4Q3TZA2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdkl4Q3TZA2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdkl4Q3TZA2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdkl4Q3TZA2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdkl4Q3TZA2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdkl4Q3TZA2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdkl4Q3TZA2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdkl4Q3TZA2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdkl4Q3TZA2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdkl4Q3TZA2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdkl4Q3TZA2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdkl4Q3TZA2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdkl4Q3TZA2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdkl4Q3TZA2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdkl4Q3TZA2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdkl4Q3TZA2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdkl4Q3TZA2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdkl4Q3TZA2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdkl4Q3TZA2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdkl4Q3TZA2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdkl4Q3TZA2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdkl4Q3TZA2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdkl4Q3TZA2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdkl4Q3TZA2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdkl4Q3TZA2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdkl4Q3TZA2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdkl4Q3TZA2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdkl4Q3TZA2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdkl4Q3TZA2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdkl4Q3TZA2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdkl4Q3TZA2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdkl4Q3TZA2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdkl4Q3TZA2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdkl4Q3TZA2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdkl4Q3TZA2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdkl4Q3TZA2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdkl4Q3TZA2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdkl4Q3TZA2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdkl4Q3TZA2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdkl4Q3TZA2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdkl4Q3TZA2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdkl4Q3TZA2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdkl4Q3TZA2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdkl4Q3TZA2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms