Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccbe1Q3MI99 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccbe1Q3MI99 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccbe1Q3MI99 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccbe1Q3MI99 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccbe1Q3MI99 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccbe1Q3MI99 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccbe1Q3MI99 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccbe1Q3MI99 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccbe1Q3MI99 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccbe1Q3MI99 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccbe1Q3MI99 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms