Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Samd11Q1RNF8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Samd11Q1RNF8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Samd11Q1RNF8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Samd11Q1RNF8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Samd11Q1RNF8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Samd11Q1RNF8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Samd11Q1RNF8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Samd11Q1RNF8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Samd11Q1RNF8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Samd11Q1RNF8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Samd11Q1RNF8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Samd11Q1RNF8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Samd11Q1RNF8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Samd11Q1RNF8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Samd11Q1RNF8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Samd11Q1RNF8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Samd11Q1RNF8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Samd11Q1RNF8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Samd11Q1RNF8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Samd11Q1RNF8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Samd11Q1RNF8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Samd11Q1RNF8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Samd11Q1RNF8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Samd11Q1RNF8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Samd11Q1RNF8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Samd11Q1RNF8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Samd11Q1RNF8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Samd11Q1RNF8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Samd11Q1RNF8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Samd11Q1RNF8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Samd11Q1RNF8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Samd11Q1RNF8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Samd11Q1RNF8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Samd11Q1RNF8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Samd11Q1RNF8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Samd11Q1RNF8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Samd11Q1RNF8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Samd11Q1RNF8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Samd11Q1RNF8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Samd11Q1RNF8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Samd11Q1RNF8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Samd11Q1RNF8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Samd11Q1RNF8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Samd11Q1RNF8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Samd11Q1RNF8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Samd11Q1RNF8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Samd11Q1RNF8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Samd11Q1RNF8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Samd11Q1RNF8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Samd11Q1RNF8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Samd11Q1RNF8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Samd11Q1RNF8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Samd11Q1RNF8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Samd11Q1RNF8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Samd11Q1RNF8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Samd11Q1RNF8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Samd11Q1RNF8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Samd11Q1RNF8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Samd11Q1RNF8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Samd11Q1RNF8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Samd11Q1RNF8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Samd11Q1RNF8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Samd11Q1RNF8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Samd11Q1RNF8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Samd11Q1RNF8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Samd11Q1RNF8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Samd11Q1RNF8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Samd11Q1RNF8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Samd11Q1RNF8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Samd11Q1RNF8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Samd11Q1RNF8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms