Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rpusd2Q149F1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rpusd2Q149F1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rpusd2Q149F1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Rpusd2Q149F1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Rpusd2Q149F1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rpusd2Q149F1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rpusd2Q149F1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rpusd2Q149F1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rpusd2Q149F1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rpusd2Q149F1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rpusd2Q149F1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rpusd2Q149F1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rpusd2Q149F1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Rpusd2Q149F1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rpusd2Q149F1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rpusd2Q149F1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rpusd2Q149F1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpusd2Q149F1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpusd2Q149F1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpusd2Q149F1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpusd2Q149F1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpusd2Q149F1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpusd2Q149F1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpusd2Q149F1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpusd2Q149F1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpusd2Q149F1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpusd2Q149F1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpusd2Q149F1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpusd2Q149F1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpusd2Q149F1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rpusd2Q149F1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpusd2Q149F1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpusd2Q149F1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpusd2Q149F1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpusd2Q149F1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpusd2Q149F1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpusd2Q149F1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpusd2Q149F1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpusd2Q149F1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rpusd2Q149F1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rpusd2Q149F1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rpusd2Q149F1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rpusd2Q149F1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rpusd2Q149F1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rpusd2Q149F1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rpusd2Q149F1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rpusd2Q149F1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rpusd2Q149F1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rpusd2Q149F1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rpusd2Q149F1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rpusd2Q149F1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rpusd2Q149F1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rpusd2Q149F1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rpusd2Q149F1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Rpusd2Q149F1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rpusd2Q149F1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rpusd2Q149F1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rpusd2Q149F1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rpusd2Q149F1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rpusd2Q149F1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rpusd2Q149F1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rpusd2Q149F1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rpusd2Q149F1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpusd2Q149F1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpusd2Q149F1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rpusd2Q149F1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rpusd2Q149F1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Rpusd2Q149F1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpusd2Q149F1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms