Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Perm1Q149B8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Perm1Q149B8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Perm1Q149B8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Perm1Q149B8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Perm1Q149B8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Perm1Q149B8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Perm1Q149B8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Perm1Q149B8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Perm1Q149B8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Perm1Q149B8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Perm1Q149B8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Perm1Q149B8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Perm1Q149B8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Perm1Q149B8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Perm1Q149B8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Perm1Q149B8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Perm1Q149B8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Perm1Q149B8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Perm1Q149B8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Perm1Q149B8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Perm1Q149B8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Perm1Q149B8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Perm1Q149B8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Perm1Q149B8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Perm1Q149B8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Perm1Q149B8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Perm1Q149B8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Perm1Q149B8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Perm1Q149B8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Perm1Q149B8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Perm1Q149B8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Perm1Q149B8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Perm1Q149B8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Perm1Q149B8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Perm1Q149B8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Perm1Q149B8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Perm1Q149B8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Perm1Q149B8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Perm1Q149B8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Perm1Q149B8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Perm1Q149B8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Perm1Q149B8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Perm1Q149B8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Perm1Q149B8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Perm1Q149B8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Perm1Q149B8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Perm1Q149B8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Perm1Q149B8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Perm1Q149B8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Perm1Q149B8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Perm1Q149B8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Perm1Q149B8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Perm1Q149B8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Perm1Q149B8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Perm1Q149B8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Perm1Q149B8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Perm1Q149B8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Perm1Q149B8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Perm1Q149B8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Perm1Q149B8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Perm1Q149B8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Perm1Q149B8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Perm1Q149B8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Perm1Q149B8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Perm1Q149B8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Perm1Q149B8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Perm1Q149B8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Perm1Q149B8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Perm1Q149B8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Perm1Q149B8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Perm1Q149B8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Perm1Q149B8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Perm1Q149B8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Perm1Q149B8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Perm1Q149B8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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