Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc39dQ0VF76 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc39dQ0VF76 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ttc39dQ0VF76 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ttc39dQ0VF76 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ttc39dQ0VF76 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ttc39dQ0VF76 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ttc39dQ0VF76 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc39dQ0VF76 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ttc39dQ0VF76 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc39dQ0VF76 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ttc39dQ0VF76 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc39dQ0VF76 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc39dQ0VF76 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc39dQ0VF76 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc39dQ0VF76 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc39dQ0VF76 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc39dQ0VF76 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ttc39dQ0VF76 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ttc39dQ0VF76 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ttc39dQ0VF76 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc39dQ0VF76 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc39dQ0VF76 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ttc39dQ0VF76 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc39dQ0VF76 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc39dQ0VF76 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc39dQ0VF76 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc39dQ0VF76 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ttc39dQ0VF76 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc39dQ0VF76 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc39dQ0VF76 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ttc39dQ0VF76 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttc39dQ0VF76 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ttc39dQ0VF76 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc39dQ0VF76 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc39dQ0VF76 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc39dQ0VF76 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ttc39dQ0VF76 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc39dQ0VF76 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ttc39dQ0VF76 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttc39dQ0VF76 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttc39dQ0VF76 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ttc39dQ0VF76 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc39dQ0VF76 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttc39dQ0VF76 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttc39dQ0VF76 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc39dQ0VF76 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc39dQ0VF76 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttc39dQ0VF76 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc39dQ0VF76 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttc39dQ0VF76 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttc39dQ0VF76 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc39dQ0VF76 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
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