Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,83■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,83■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15,83■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15,83■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15,82■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15,81■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15,81■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15,81■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15,81■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,81■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,81■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,81■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,8■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,78■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15,78■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15,78■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,12
Pglyrp4Q0VB07 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,76■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15,76■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,76■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15,76■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,76■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,76■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,76■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15,76■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,75■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15,75■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,75■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15,75■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,75■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,75■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15,75■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,74■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15,73■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,73■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15,73■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15,73■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,73■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15,72■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15,72■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,72■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,71■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,71■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15,71■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,71■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,71■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,71■□□□□ 0,11
Pglyrp4Q0VB07 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15,71■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15,71■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,71■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,7■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15,7■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,7■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,7■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,7■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,69■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,69■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15,69■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,69■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,69■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,69■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,69■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15,69■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,69■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,69■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15,69■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,69■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15,69■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,68■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,68■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,68■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,68■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15,68■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15,68■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,68■□□□□ 0,1
Pglyrp4Q0VB07 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,68■□□□□ 0,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms