Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cntnap5cQ0V8T7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cntnap5cQ0V8T7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cntnap5cQ0V8T7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cntnap5cQ0V8T7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cntnap5cQ0V8T7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cntnap5cQ0V8T7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cntnap5cQ0V8T7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cntnap5cQ0V8T7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cntnap5cQ0V8T7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cntnap5cQ0V8T7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cntnap5cQ0V8T7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cntnap5cQ0V8T7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cntnap5cQ0V8T7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cntnap5cQ0V8T7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cntnap5cQ0V8T7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cntnap5cQ0V8T7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cntnap5cQ0V8T7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cntnap5cQ0V8T7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cntnap5cQ0V8T7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cntnap5cQ0V8T7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cntnap5cQ0V8T7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cntnap5cQ0V8T7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cntnap5cQ0V8T7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cntnap5cQ0V8T7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cntnap5cQ0V8T7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cntnap5cQ0V8T7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cntnap5cQ0V8T7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cntnap5cQ0V8T7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cntnap5cQ0V8T7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cntnap5cQ0V8T7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cntnap5cQ0V8T7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cntnap5cQ0V8T7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cntnap5cQ0V8T7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cntnap5cQ0V8T7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cntnap5cQ0V8T7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cntnap5cQ0V8T7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cntnap5cQ0V8T7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cntnap5cQ0V8T7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cntnap5cQ0V8T7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cntnap5cQ0V8T7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Cntnap5cQ0V8T7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cntnap5cQ0V8T7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cntnap5cQ0V8T7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cntnap5cQ0V8T7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cntnap5cQ0V8T7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cntnap5cQ0V8T7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cntnap5cQ0V8T7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Cntnap5cQ0V8T7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cntnap5cQ0V8T7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cntnap5cQ0V8T7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cntnap5cQ0V8T7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cntnap5cQ0V8T7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cntnap5cQ0V8T7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cntnap5cQ0V8T7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cntnap5cQ0V8T7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cntnap5cQ0V8T7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cntnap5cQ0V8T7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cntnap5cQ0V8T7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cntnap5cQ0V8T7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cntnap5cQ0V8T7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cntnap5cQ0V8T7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cntnap5cQ0V8T7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cntnap5cQ0V8T7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms