Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
AmbpQ07456 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AmbpQ07456 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AmbpQ07456 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AmbpQ07456 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AmbpQ07456 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AmbpQ07456 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AmbpQ07456 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AmbpQ07456 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AmbpQ07456 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
AmbpQ07456 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AmbpQ07456 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
AmbpQ07456 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AmbpQ07456 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AmbpQ07456 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AmbpQ07456 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
AmbpQ07456 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AmbpQ07456 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
AmbpQ07456 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AmbpQ07456 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
AmbpQ07456 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmbpQ07456 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmbpQ07456 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmbpQ07456 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
AmbpQ07456 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
AmbpQ07456 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms