Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sox4Q06831 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sox4Q06831 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sox4Q06831 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox4Q06831 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox4Q06831 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox4Q06831 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sox4Q06831 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox4Q06831 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox4Q06831 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sox4Q06831 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox4Q06831 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox4Q06831 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox4Q06831 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox4Q06831 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox4Q06831 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox4Q06831 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox4Q06831 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox4Q06831 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox4Q06831 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox4Q06831 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox4Q06831 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox4Q06831 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox4Q06831 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms