Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nf1Q04690 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nf1Q04690 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nf1Q04690 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nf1Q04690 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nf1Q04690 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Nf1Q04690 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nf1Q04690 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nf1Q04690 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nf1Q04690 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nf1Q04690 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nf1Q04690 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nf1Q04690 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nf1Q04690 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nf1Q04690 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nf1Q04690 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nf1Q04690 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nf1Q04690 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms