Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CkbQ04447 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CkbQ04447 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CkbQ04447 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CkbQ04447 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CkbQ04447 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CkbQ04447 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CkbQ04447 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CkbQ04447 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CkbQ04447 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CkbQ04447 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CkbQ04447 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CkbQ04447 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CkbQ04447 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CkbQ04447 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CkbQ04447 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CkbQ04447 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CkbQ04447 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CkbQ04447 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CkbQ04447 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CkbQ04447 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CkbQ04447 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CkbQ04447 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CkbQ04447 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CkbQ04447 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CkbQ04447 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CkbQ04447 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CkbQ04447 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CkbQ04447 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CkbQ04447 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CkbQ04447 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CkbQ04447 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CkbQ04447 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CkbQ04447 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CkbQ04447 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CkbQ04447 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CkbQ04447 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CkbQ04447 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CkbQ04447 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CkbQ04447 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CkbQ04447 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CkbQ04447 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CkbQ04447 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CkbQ04447 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CkbQ04447 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CkbQ04447 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CkbQ04447 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CkbQ04447 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CkbQ04447 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CkbQ04447 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CkbQ04447 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CkbQ04447 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CkbQ04447 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CkbQ04447 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CkbQ04447 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CkbQ04447 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CkbQ04447 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CkbQ04447 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CkbQ04447 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CkbQ04447 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CkbQ04447 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CkbQ04447 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CkbQ04447 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CkbQ04447 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CkbQ04447 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CkbQ04447 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CkbQ04447 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CkbQ04447 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CkbQ04447 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CkbQ04447 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CkbQ04447 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CkbQ04447 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CkbQ04447 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CkbQ04447 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CkbQ04447 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CkbQ04447 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms