Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcnb1Q03717 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcnb1Q03717 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Kcnb1Q03717 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Kcnb1Q03717 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcnb1Q03717 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcnb1Q03717 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Kcnb1Q03717 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcnb1Q03717 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcnb1Q03717 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcnb1Q03717 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Kcnb1Q03717 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnb1Q03717 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnb1Q03717 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnb1Q03717 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnb1Q03717 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcnb1Q03717 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcnb1Q03717 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcnb1Q03717 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcnb1Q03717 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcnb1Q03717 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcnb1Q03717 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcnb1Q03717 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcnb1Q03717 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Kcnb1Q03717 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcnb1Q03717 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcnb1Q03717 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Kcnb1Q03717 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Kcnb1Q03717 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcnb1Q03717 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcnb1Q03717 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcnb1Q03717 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcnb1Q03717 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcnb1Q03717 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcnb1Q03717 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcnb1Q03717 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kcnb1Q03717 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kcnb1Q03717 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kcnb1Q03717 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kcnb1Q03717 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kcnb1Q03717 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kcnb1Q03717 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kcnb1Q03717 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kcnb1Q03717 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kcnb1Q03717 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kcnb1Q03717 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kcnb1Q03717 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kcnb1Q03717 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kcnb1Q03717 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kcnb1Q03717 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kcnb1Q03717 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kcnb1Q03717 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kcnb1Q03717 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kcnb1Q03717 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kcnb1Q03717 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kcnb1Q03717 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kcnb1Q03717 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kcnb1Q03717 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kcnb1Q03717 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kcnb1Q03717 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnb1Q03717 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnb1Q03717 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnb1Q03717 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnb1Q03717 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kcnb1Q03717 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kcnb1Q03717 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Kcnb1Q03717 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kcnb1Q03717 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Kcnb1Q03717 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kcnb1Q03717 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kcnb1Q03717 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcnb1Q03717 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcnb1Q03717 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcnb1Q03717 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcnb1Q03717 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnb1Q03717 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnb1Q03717 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnb1Q03717 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnb1Q03717 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcnb1Q03717 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcnb1Q03717 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcnb1Q03717 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnb1Q03717 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnb1Q03717 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcnb1Q03717 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnb1Q03717 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnb1Q03717 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnb1Q03717 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnb1Q03717 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnb1Q03717 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnb1Q03717 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnb1Q03717 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnb1Q03717 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnb1Q03717 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnb1Q03717 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnb1Q03717 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnb1Q03717 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnb1Q03717 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms