Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Epha4Q03137 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Epha4Q03137 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Epha4Q03137 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Epha4Q03137 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Epha4Q03137 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Epha4Q03137 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epha4Q03137 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epha4Q03137 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Epha4Q03137 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Epha4Q03137 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Epha4Q03137 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Epha4Q03137 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Epha4Q03137 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epha4Q03137 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Epha4Q03137 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epha4Q03137 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Epha4Q03137 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epha4Q03137 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Epha4Q03137 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epha4Q03137 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms