Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb5Q02739 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gjb5Q02739 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb5Q02739 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gjb5Q02739 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb5Q02739 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gjb5Q02739 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb5Q02739 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb5Q02739 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb5Q02739 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb5Q02739 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb5Q02739 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gjb5Q02739 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb5Q02739 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gjb5Q02739 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb5Q02739 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb5Q02739 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb5Q02739 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gjb5Q02739 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gjb5Q02739 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gjb5Q02739 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gjb5Q02739 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb5Q02739 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gjb5Q02739 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb5Q02739 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb5Q02739 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gjb5Q02739 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb5Q02739 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb5Q02739 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb5Q02739 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb5Q02739 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb5Q02739 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb5Q02739 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gjb5Q02739 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb5Q02739 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb5Q02739 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb5Q02739 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb5Q02739 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb5Q02739 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gjb5Q02739 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gjb5Q02739 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gjb5Q02739 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb5Q02739 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb5Q02739 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gjb5Q02739 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb5Q02739 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gjb5Q02739 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb5Q02739 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb5Q02739 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gjb5Q02739 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb5Q02739 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb5Q02739 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb5Q02739 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gjb5Q02739 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb5Q02739 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb5Q02739 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb5Q02739 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gjb5Q02739 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb5Q02739 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb5Q02739 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb5Q02739 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb5Q02739 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb5Q02739 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb5Q02739 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb5Q02739 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb5Q02739 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb5Q02739 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb5Q02739 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb5Q02739 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb5Q02739 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb5Q02739 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb5Q02739 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb5Q02739 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb5Q02739 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb5Q02739 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb5Q02739 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms