Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Uba1Q02053 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uba1Q02053 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uba1Q02053 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uba1Q02053 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Uba1Q02053 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uba1Q02053 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Uba1Q02053 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Uba1Q02053 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uba1Q02053 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uba1Q02053 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uba1Q02053 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Uba1Q02053 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uba1Q02053 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Uba1Q02053 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uba1Q02053 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uba1Q02053 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Uba1Q02053 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uba1Q02053 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Uba1Q02053 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Uba1Q02053 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Uba1Q02053 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uba1Q02053 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Uba1Q02053 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Uba1Q02053 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uba1Q02053 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uba1Q02053 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Uba1Q02053 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uba1Q02053 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uba1Q02053 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uba1Q02053 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uba1Q02053 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uba1Q02053 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Uba1Q02053 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uba1Q02053 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Uba1Q02053 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Uba1Q02053 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Uba1Q02053 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uba1Q02053 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uba1Q02053 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Uba1Q02053 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Uba1Q02053 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Uba1Q02053 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Uba1Q02053 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Uba1Q02053 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Uba1Q02053 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uba1Q02053 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Uba1Q02053 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Uba1Q02053 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Uba1Q02053 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Uba1Q02053 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Uba1Q02053 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Uba1Q02053 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms