Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VcpQ01853 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VcpQ01853 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VcpQ01853 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VcpQ01853 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VcpQ01853 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VcpQ01853 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VcpQ01853 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VcpQ01853 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VcpQ01853 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VcpQ01853 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VcpQ01853 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VcpQ01853 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VcpQ01853 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VcpQ01853 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VcpQ01853 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VcpQ01853 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VcpQ01853 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VcpQ01853 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VcpQ01853 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VcpQ01853 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VcpQ01853 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VcpQ01853 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VcpQ01853 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VcpQ01853 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VcpQ01853 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VcpQ01853 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VcpQ01853 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VcpQ01853 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VcpQ01853 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VcpQ01853 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VcpQ01853 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VcpQ01853 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VcpQ01853 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VcpQ01853 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VcpQ01853 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VcpQ01853 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VcpQ01853 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VcpQ01853 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VcpQ01853 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VcpQ01853 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VcpQ01853 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VcpQ01853 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VcpQ01853 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VcpQ01853 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VcpQ01853 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VcpQ01853 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VcpQ01853 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VcpQ01853 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VcpQ01853 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VcpQ01853 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VcpQ01853 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VcpQ01853 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VcpQ01853 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms