Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itga4Q00651 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itga4Q00651 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga4Q00651 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga4Q00651 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itga4Q00651 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga4Q00651 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga4Q00651 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga4Q00651 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga4Q00651 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga4Q00651 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga4Q00651 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga4Q00651 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga4Q00651 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga4Q00651 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga4Q00651 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga4Q00651 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga4Q00651 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga4Q00651 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga4Q00651 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga4Q00651 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga4Q00651 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga4Q00651 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga4Q00651 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga4Q00651 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga4Q00651 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga4Q00651 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga4Q00651 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga4Q00651 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga4Q00651 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga4Q00651 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga4Q00651 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga4Q00651 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga4Q00651 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itga4Q00651 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itga4Q00651 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms