Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HmmrQ00547 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HmmrQ00547 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HmmrQ00547 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HmmrQ00547 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HmmrQ00547 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HmmrQ00547 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HmmrQ00547 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HmmrQ00547 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HmmrQ00547 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HmmrQ00547 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HmmrQ00547 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HmmrQ00547 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HmmrQ00547 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HmmrQ00547 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HmmrQ00547 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HmmrQ00547 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HmmrQ00547 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HmmrQ00547 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HmmrQ00547 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HmmrQ00547 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HmmrQ00547 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HmmrQ00547 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HmmrQ00547 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HmmrQ00547 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms