Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp9bP98195 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp9bP98195 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp9bP98195 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp9bP98195 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp9bP98195 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp9bP98195 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp9bP98195 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp9bP98195 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp9bP98195 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp9bP98195 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp9bP98195 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp9bP98195 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp9bP98195 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp9bP98195 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp9bP98195 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp9bP98195 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp9bP98195 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp9bP98195 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp9bP98195 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atp9bP98195 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp9bP98195 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp9bP98195 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp9bP98195 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp9bP98195 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp9bP98195 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp9bP98195 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp9bP98195 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp9bP98195 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp9bP98195 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp9bP98195 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp9bP98195 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp9bP98195 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp9bP98195 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp9bP98195 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp9bP98195 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp9bP98195 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp9bP98195 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp9bP98195 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp9bP98195 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atp9bP98195 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atp9bP98195 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp9bP98195 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp9bP98195 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp9bP98195 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp9bP98195 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp9bP98195 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp9bP98195 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp9bP98195 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp9bP98195 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp9bP98195 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp9bP98195 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp9bP98195 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms