Protein–RNA interactions for Protein: P97357

Taf1a, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1aP97357 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Taf1aP97357 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1aP97357 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1aP97357 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Taf1aP97357 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1aP97357 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Taf1aP97357 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf1aP97357 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Taf1aP97357 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf1aP97357 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1aP97357 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1aP97357 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf1aP97357 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1aP97357 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1aP97357 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1aP97357 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Taf1aP97357 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1aP97357 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf1aP97357 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf1aP97357 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf1aP97357 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf1aP97357 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf1aP97357 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf1aP97357 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf1aP97357 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf1aP97357 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Taf1aP97357 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf1aP97357 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf1aP97357 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1aP97357 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Taf1aP97357 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1aP97357 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1aP97357 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1aP97357 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1aP97357 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Taf1aP97357 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf1aP97357 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Taf1aP97357 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.9 ms